Poltekkes Kemenkes Aceh berdiri pada tanggal 12 Nopember 2001 berdasarkan SK Menteri Kesehatan RI No. 1207/Menkes/SK/XI/2001. Institusi ini merupakan hasil konversi dari beberapa jenjang Diploma III yaitu AKBID, AKPER, SPAG, AKL/SPPH, SPRG yang merupakan cikal bakal berdirinya Jurusan Kebidanan, Keperawatan, Gizi, Kesehatan Lingkungan dan Keperawatan Gigi. Tahun 2012 Pembinaan Akademik semua Program Studi dibawah Poltekkes Kemenkes Aceh beralih kepada Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan RI sesuai SK No.355/E/O/2012 tanggal 10 Oktober 2012.
Sejak tahun 2001 ada perubahan dalam struktur kelembagaan pendidikan tenaga kesehatan dibawah Depkes RI. Bentuk perubahan tersebut berupa terbentuknya lembaga pendidikan tenaga kesehatan di masing-masing propinsi di Indonesia dengan nama Politeknik Kesehatan (Poltekkes Depkes). Sekolah/ Akademi tenaga kesehatan yang berada di bawah Depkes RI dikonversi menjadi Jurusan/Prodi termasuk AKBID Banda Aceh. Selanjutnya AKBID Banda Aceh berubah menjadi Jurusan Kebidanan Poltekkes Kemenkes Aceh. Awal mula berdiri, Jurusan Kebidanan berada di lokasi Gedung Rumah Sakit Umum Zainoel Abidin Lampriet Banda Aceh. Namun sejak 2019 sampai saat ini kampus Jurusan Kebidanan bergabung di Kampus Terpadu Poltekkes Kemenkes Aceh, beralamat di Jalan Soekarno-Hatta Desa Lheu Blang Kecamatan Darul Imarah Kabupaten Aceh Besar.
Poltekkes Kemenkes Aceh saat ini mengelola 6 jurusan yaitu Jurusan Kebidanan, Keperawatan, Gizi, Kesehatan Lingkungan, Kesehatan Gigi dan Farmasi. Jumlah prodi keseluruhan dari jurusan yang ada yaitu 21 program studi, 6 diantaranya bergabung hasil kebijakan mergerisasi PT Kesda sejak 2019. Selain kampus utama yang berada di Aceh Besar, terdapat 7 lokasi diluar kampus utama. Lokasi yang dimaksud adalah Kota Banda Aceh, Langsa, Aceh Barat, Aceh Utara, Aceh Tengah, Aceh Selatan dan Aceh Tenggara. Kampus terpadu Poltekkes Kemenkes Aceh beralamat di jalan Soekarno-Hatta Desa Lheu Blang Kecamatan Darul Imarah Kabupaten Aceh Besar Jurusan Kebidanan Poltekkes Kemenkes Aceh berdiri sejak terbentuknya Poltekkes Kemenkes Aceh pada 12 Nopember 2001 sesuai SK Menteri Kesehatan RI No. 1207/MENKES/SK/XI/2001. Jurusan Kebidanan sebagai pengelola Pendidikan vokasi bidang kebidanan untuk program studi Diploma III Kebidanan dan Sarjana Terapan Kebidanan. Program studi Sarjana Terapan Kebidanan merupakan institusi jenjang Pendidikan tinggi Sarjana Terapan Kesehatan yang memiliki tupoksi sebagai pelaksana proses belajar mengajar. Prodi Sarjana Terapan Kebidanan berdiri sejak tahun 2012 sesuai SK Menteri Pendidikan dan Kebudayaan No. 355/E/0/2012 tanggal 10 Oktober 2012. Prodi Sarjana Terapan Kebidanan telah meluluskan 5 angkatan dari program regular, dengan lulusan pertama di tahun 2018 (2014-2018).